LU MF Internās medicīnas katedras Personalizētās medicīnas laboratorijas darbinieki realizē nacionālos un starptautiskos zinātniskos projektus diabēta komplikāciju izpētes jomā. Laboratorijas pētnieciskās aktivitātes ir vērstas uz diabēta komplikāciju labāku diagnostikas un ārstēšanas metožu attīstību.
Aktuālie projekti
- Projekta numurs: 101095672
- Projekta mērķis: Testēt projektā izstrādāto matemātisko algoritmu (physics-informed machine learning (PIML) algorithm), kas tiks dizainēts prediabēta jeb glikozes tolerances traucējumu reālā laika riska noteikšanai.
- Projekta darba grupa:
Projekta vadītāja vadītāja Latvijā, vadošā pētniece Dr.med. Jeļizaveta Sokolovska
Projekta administratīvā vadītāja Laureta Buševica
Medicīnas māsa Irēna Puzirevska
Medicīnas māsa, zinātniskais asistents Aleksejs Fedulovs
Vecākā eksperte Sabīne Skrebinska
Vecākā eksperte Guna Bīlande
Pētniece, asociētā profesore Dr. biol. Līga Plakane
Pētniece Mg.sci. Zane Šmite
Pētniece Mg.sci Sofija Ivanova
Pētniece Marina Arisova - Projekta īstenošanas laiks: 01.01.2023 -31.03.2025.
- Projekta kopējais finansējums: 5 808 740 EUR
- Projekta koordinators ir informācijas un komunikācijas tehnoloģiju centrs Spindox (Trento, Itālija). Projekta partneri: Latvijas Universitāte, Elektronikas un datorzinātņu institūts (EDI) (Latvija), Grācas Medicīnas universitāte (Grāca, Austrija), Itālijas pētniecības padome - Lietišķās skaitļošanas institūts (Roma, Itālija), Dienvidšveices Lietišķo zinātņu un mākslas universitāte (Manno, Šveice), konsultācijas uzņēmums Euronet (Brisele, Beļģija), Robotikas skola (Dženova, Itālija), uzņēmums “CheckHealth“ (Danderida, Zviedrija), Itālijas aknu fonds ONLUS (Trieste, Itālija), uzņēmums HK3 LAB S.R.L (Rovereto, Itālija).
- Projekta oficiālā mājaslapa: https://praesiidium.spindoxlabs.com/
- Projekta numurs: EEA-RESEARCH-60
- Projekta mērķis: Ieviest diabēta pacientu aprūpē jaunu uz mākslīgā intelekta bāzētu diabētiskās retinopātijas skrīninga un monitorēšanas programmu.
- Projekta darba grupa:
Projekta vadītāja, vadošā pētniece Jeļizaveta Sokolovska
Vecākā eksperte Zane Svikle
Asociētā profesore Kristīne Baumane
Vecākā eksperte Beate Pēterfelde
Profesors Jānis Valeinis
Vecākā eksperte Dace Pētersone - Projekta īstenošanas laiks: 01.05.2021. – 30.04.2024.
- Projekta kopējais finansējums: 1 000 000 EUR
- Projektu īsteno Latvijas Universitāte sadarbībā ar Oslo Universitāti, Tartu Universitāti un Lietuvas Veselības zinātņu universitāti.
- Projekta mērķis: Identificēt ģenētiskos, vides un bioķīmiskos faktorus, kuri ietekmē 1. tipa cukura diabēta komplikāciju attīstību. Pētījums notiek sadarbībā ar Valsts Iedzīvotāju genoma datu bāzi. Pētījumā tiek aicināti iesaistīties visi pieaugušie indivīdi ar 1. tipa cukura diabētu. Iesaistīšanās vizītes gaitā tiek ievākti pacientu bioloģiskie paraugi, ievākta informācija par antropometriskiem datiem, kā arī aizpilda anketas par diabēta gaitu un dzīvesveida faktoriem. Uz nākamo vizīti pacients tiek aicināts pēc 3-5 gadiem.
- Projekta īstenošanas laiks: 2013- nepārtraukti
- Projekta vadītāja: Dr. med. Jeļizaveta Sokolovska
- Projekta darba grupa:
Docente Kristīne Baumane
Asociētā profesore Inese Folkmane
Profesors Valdis Pīrāgs
Leonora Pahirko, LU Fizikas, matemātikas un optometrijas fakultāte
Edgars Salna, LU Inovāciju centrs
Natalia Paramonova, LU Bioloģijas institūts
Vita Rovīte, Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs
Projekta gaitā ir iegūti un nopublicēti vērtīgi rezultāti par diabēta komplikāciju patoģenēzi, tai skaitā ģenētiskām mutācijām, kuras ietekmē diabētiskās nieru slimības risku. Viens no LatDiane pētnieku un starptautisko sadarbības partneru 2019. gada sasniegumiem ieguvis Latvijas Zinātņu akadēmijas atzinības rakstu.
Noslēgtie projekti
- Projekta numurs: lzp-2020/1-0138
- Projekta mērķis: Novērtēt glikozes variabilitātes (svārstību) asociāciju ar zarnu iekaisumu, mikrobioma izmaiņām un sistēmisko iekaisumu pacientiem ar 1. tipa cukura diabētu un dažādām diabētiskās nieru slimības stadijām.
- Projekta darba grupa:
Projekta vadītāja, vadošā pētniece Jeļizaveta Sokolovska
Prof. Inese Folkmane
Māsa Aleksejs Fedulovs
Māsa Irēna Puzirevska
Pētn. Kaspars Jēkabsons
Pētn. Līga Kunrade
Prof. Valdis Pīrāgs
Vec. eksperte Poļina Zaļizko
Lekt. Leonora Pahirko, LU FMOF
Ilze Elbere, Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs
Ivars Silamiķelis, Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centrs
Una Lauga-Tuņina, Bērnu klīniskā universitātes slimnīca
Studente Lelde Krūzmane, LU Rezidentūras attīstības programma
Studente Jana Janeviča, Rīgas Stradiņa universitāte
Studente Sofija Ivanova, LU, LLU un RSU maģistra studiju programma “Uzturzinātne”
Studente Angelina Tiščuka, LU FMOF - Projekta īstenošanas laiks: 01.2021.-12.2023.
- Projekta kopējais finansējums: 300000 EUR
- Projektu īsteno Latvijas Universitāte sadarbībā ar Latvijas Biomedicīnas pētījumu un studiju centru
- Projekta līguma numurs: 1.1.1.2/VIAA/3/19/525
- Projekta mērķis: Novērtēt asociāciju starp zarnu iekaisuma marķieriem fēcēs, iekaisuma marķieriem serumā un diētas faktoriem pacientiem ar 1. tipa cukura diabētu un dažādu diabētiskās nefropātijas attīstības ātrumu. Projekta sākumposmā tiks veidotas pētījuma dalībnieku grupas ar dažādu diabētiskās nefropātijas gaitu. Dalībnieki aizpildīs pārtikas biežuma anketas un trīs dienu uztura dienasgrāmatas. Ievāktajos fēču un asins seruma paraugos tiks noteikti iekaisuma marķieri zarnu un sistēmiska iekaisuma raksturošanai. Tiks pētīta asociācija starp diētas faktoriem, zarnu iekaisuma marķieriem un seruma sistēmisko iekaisumu. Projekta noslēguma fāzē tiks veidota datu platforma, kas apkopos pētījumā iegūtos datus. Tiks nodrošināta datu organizāciju tādā veidā, lai to varētu izmantot citi pētnieki un tiks izveidots datu piekļuves algoritms.
- Projekta vadītāja: Jeļizaveta Sokolovska
- Projekta īstenošanas laiks: 01.04.2020-31.03.2023
- Projekta mērķis: Izpētīt telomēru garuma, DNS metilācijas pakāpes un proteasomu koncentrācijas serumā asociāciju ar diabētiskās retinopātijas smagumu. Projekta ietvaros piedalīties tiek aicināti pacienti ar 1. tipa cukura diabētu. Pacienti tiek izmeklēti pie oftalmologa, nosakot viņiem diabēta komplikācijas - diabētiskās retinopātijas pakāpi. Tāpat tiek savākti dati par diabēta gaitu un tiek savākti asins paraugi DNS un seruma iegūšanai. Pacientu bioloģiskajos paraugos tiek noteikts telomēru garums, DNS metilācijas pakāpe un proteasomu koncentārācija. Projekta rezultāti palīdzēs identificēt jaunus diabētiskās retinopātijas biomarķierus, ko nākotnē varēs izmantot slimības prognozes noteikšanai.
- Projekta darba grupa:
Projekta vadītāja, vadošā pētniece Jeļizaveta Sokolovska
Doc. Kristīne Baumane,
Natālija Paramonova, LU Bioloģijas institūts
Leonora Pahirko, LU Fizikas, matemātikas un optometrijas fakultāte - Projekta īstenošanas laiks: 2019-2021
- Projekta mērķis: Veicināt 2. tipa cukura diabēta pacientu veselības un dzīves kvalitātes uzlabošana ar intervāla metodes fizisko aktivitāšu programmu monitoringu un vadību ar mobilas ierīces palīdzību.
- Projekta īstenošanas laiks: 2017-2019
- Projekta darba grupa:
Projekta vadītājs, prof. Leo Seļāvo, LU Datorikas fakultāte
Vad. pētniece Jeļizaveta Sokolovska, LU Medicīnas fakultāte
Prof. Aija Kļaviņa, Latvijas Sporta pedagoģijas akadēmija
Uzlabojot veselības stāvokli, mazināsies atkarību no medikamentiem un dotu pozitīvu ekonomisko efekts, nodrošinot pacientiem individuālu ārstēšanas procesu. Pēc projekta izpildes šiem cilvēkiem būtu pieejams inovatīvs, komplekss risinājums savas veselības uzlabošanā.
Projekts īstenots, pateicoties mecenāta Mikrotīkls atbalstam, to administrēja LU fonds. Sekmīgu projekta norisi atbalstīja arī Latvijas Mobilais Telefons un Foracare, kuri ziedoja viedtālruņus un glikometrus.
Publikācijas
- Ustinova M, Peculis R, Rescenko R, Rovite V, Zaharenko L, Elbere I, Silamikele L, Konrade I, Sokolovska J, Pirags V, Klovins J Novel susceptibility loci identified in a genome-wide association study of type 2 diabetes complications in population of Latvia..BMC Med Genomics. 2021 Jan 11;14(1):18. doi: 10.1186/s12920-020-00860-4.
- Ustinova M, Ansone L, Silamikelis I, Rovite V, Elbere I, Silamikele L, Kalnina I, Fridmanis D, Sokolovska J, Konrade I, Pirags V, Klovins J.PLoS One. 2020 Aug 11;15(8):e0237400. doi: 10.1371/journal.pone.0237400. eCollection 2020.PMID: 32780768 Whole-blood transcriptome profiling reveals signatures of metformin and its therapeutic response.
- Sokolovska J, Dekante A, Baumane L, Pahirko L, Valeinis J, Dislere K, Rovite V, Pirags V, Sjakste N.Biomed Rep. 2020 May;12(5):251-258. doi: 10.3892/br.2020.1288. Epub 2020 Mar 4.PMID: 32257188 Nitric oxide metabolism is impaired by type 1 diabetes and diabetic nephropathy.
- Leonova E, Shvirksts K, Borisovs V, Smelovs E, Sokolovska J, Bisenieks E, Duburs G, Grube M, Sjakste N.PeerJ. 2020 Nov 10;8:e10061. doi: 10.7717/peerj.10061. eCollection 2020.PMID: 33240591 . Spectroscopic and electrochemical study of interactions between DNA and different salts of 1,4-dihydropyridine AV-153.
- Zalizko P, Stefanovics J, Sokolovska J, Paramonova N, Klavina E, Erts R, Rovite V, Klovins J, Pukitis A.Therap Adv Gastroenterol. 2020 Jul 14;13:1756284820937426. doi: 10.1177/1756284820937426. eCollection 2020.PMID: 32704308. Thiopurine S-methyltransferase genetic polymorphisms in adult patients with inflammatory bowel diseases in the Latvian population.
- Sokolovska J, Stefanovics J, Gersone G, Pahirko L, Valeinis J, Kalva-Vaivode S, Rovite V, Blumfelds L, Pirags V, Tretjakovs P.Exp Clin Endocrinol Diabetes. 2020 Oct;128(10):654-662. doi: 10.1055/a-1079-4711. Epub 2020 Jan 20.PMID: 31958847. Angiopoietin 2 and Neuropeptide Y are Associated with Diabetic Kidney Disease in Type 1 Diabetes Mellitus.
- Elbere I, Silamikelis I, Dindune II, Kalnina I, Ustinova M, Zaharenko L, Silamikele L, Rovite V, Gudra D, Konrade I, Sokolovska J, Pirags V, Klovins J.PLoS One. 2020 Oct 30;15(10):e0241338. doi: 10.1371/journal.pone.0241338. eCollection 2020.PMID: 33125401 Baseline gut microbiome composition predicts metformin therapy short-term efficacy in newly diagnosed type 2 diabetes patients.
- Ahola AJ, Radzeviciene L, Zaharenko L, Bulum T, Skrebinska S, Prakapiene E, Blaslov K, Roso V, Rovite V, Pirags V, Duvnjak L, Sokolovska J, Verkauskiene R, Forsblom C.Diabetes Res Clin Pract. 2020 Dec;170:108495. doi: 10.1016/j.diabres.2020.108495. Epub 2020 Oct 13.PMID: 33058955. Association between symptoms of depression, diabetes complications and vascular risk factors in four European cohorts of individuals with type 1 diabetes - InterDiane Consortium.
- Sokolovska J, Ostrovska K, Pahirko L, Varblane G, Krilatiha K, Cirulnieks A, Folkmane I, Pirags V, Valeinis J, Klavina A, Selavo L.Physiol Rep. 2020 Jul;8(13):e14506. doi: 10.14814/phy2.14506.PMID: 32652863. Impact of interval walking training managed through smart mobile devices on albuminuria and leptin/adiponectin ratio in patients with type 2 diabetes.
- Pillar, S., Moisseiev, E., Sokolovska, J., Grzybowski, A. Recent Developments in Diabetic Retinal Neurodegeneration: A Literature Review. Journal of Diabetes Research, 2020, 2020, 5728674
- Sviklāne L, Olmane E, Dzērve Z, Kupčs K, Pīrāgs V, Sokolovska J. Fatty liver index and hepatic steatosis index for prediction of non-alcoholic fatty liver disease in type 1 diabetes. J Gastroenterol Hepatol. 2018 Jan;33(1):270-276. doi: 10.1111/jgh.13814.
- Salem RM, Todd JN, Sandholm N, Cole JB, Chen WM, Andrews D, Pezzolesi MG, McKeigue PM, Hiraki LT, Qiu C, Nair V, Di Liao C, Cao JJ, Valo E, Onengut-Gumuscu S, Smiles AM, McGurnaghan SJ, Haukka JK, Harjutsalo V, Brennan EP, van Zuydam N, Ahlqvist E, Doyle R, Ahluwalia TS, Lajer M, Hughes MF, Park J, Skupien J, Spiliopoulou A, Liu A, Menon R, Boustany-Kari CM, Kang HM, Nelson RG, Klein R, Klein BE, Lee KE, Gao X, Mauer M, Maestroni S, Caramori ML, de Boer IH, Miller RG, Guo J, Boright AP, Tregouet D, Gyorgy B, Snell-Bergeon JK, Maahs DM, Bull SB, Canty AJ, Palmer CNA, Stechemesser L, Paulweber B, Weitgasser R, Sokolovska J, Rovīte V, Pīrāgs V, Prakapiene E, Radzeviciene L, Verkauskiene R, Panduru NM, Groop LC, McCarthy MI, Gu HF, Möllsten A, Falhammar H, Brismar K, Martin F, Rossing P, Costacou T, Zerbini G, Marre M, Hadjadj S, McKnight AJ, Forsblom C, McKay G, Godson C, Maxwell AP, Kretzler M, Susztak K, Colhoun HM, Krolewski A, Paterson AD, Groop PH, Rich SS, Hirschhorn JN, Florez JC; SUMMIT Consortium, DCCT/EDIC Research Group, GENIE Consortium. „Genome-wide association study of diabetic kidney disease highlights biology involved in renal basement membrane collagen”, J Am Soc Nephrol. 2019 Oct;30(10):2000-2016. doi: 10.1681/ASN.2019030218
- Sjakste T, Paramonova N, Osina K, Dokane K, Sokolovska J, Sjakste N. Genetic variations in the PSMA3, PSMA6 and PSMC6 genes are associated with type 1 diabetes in Latvians and with expression level of number of UPS-related and T1DM-susceptible genes in HapMap individuals. Mol Genet Genomics. 2016 Apr;291(2):891-903.